Развитие целого ряда злокачественных заболеваний обусловлено определённым типом структурных нарушений ДНК – генетическими перестройками, или транслокациями. При транслокациях происходит перемещение фрагментов ДНК в геноме, из-за чего нарушается нормальное функционирование задействованных в перестройке генов. Подобный тип нарушений характерен, в том числе, для воспалительной миофибробластической опухоли – очень редкого новообразования, встречающегося у детей и подростков.
При воспалительных миофибробластических опухолях обнаруживают несколько типов транслокаций, вовлекающих ALK, ROS1 и некоторые другие гены. Выявление этих перестроек необходимо как для постановки правильного диагноза, так и для выбора лечения. Для поиска транслокаций сегодня существует несколько разных методов, таких как иммуногистохимический анализ, FISH-анализ, секвенирование нового поколения, однако все они имеют свои ограничения или же не могут использоваться в рутинной практике ввиду высокой стоимости.
Исследователями из НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова был предложен ступенчатый подход к диагностике транслокаций ALK и ROS1, включающий скрининг на возможное присутствие перестройки и дальнейшее уточнение её типа. Важно, что оба этапа диагностики основаны на применении доступного и простого метода – полимеразной цепной реакции (ПЦР). С помощью предложенной методики сотрудники лаборатории молекулярной диагностики проанализировали 29 образцов опухолей пациентов с диагнозом миофибробластическая опухоль, которые были пролечены в Центре им. Н.Н. Петрова и Центре им. Д.Рогачева в 2014-2019 годах. В комбинации с секвенированием нового поколения, клинически значимые перестройки были выявлены у большинства пациентов (24/29, 83%). Необходимо отметить, что большую часть этих транслокаций (20/24, 75%) удалось идентифицировать исключительно с помощью простых ПЦР-тестов.
Предложенный учеными подход к диагностике транслокаций ALK и ROS1 может снизить стоимость и упростить первичную диагностику редких миофибробластических опухолей.
Научный проект был поддержан Российским научным фондом (грант 18-15-00256).
Ознакомиться с текстом научной статьи можно здесь: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32064735/